Como punto de partida se puso en la mesa que el Observatorio fuera un espacio ciudadano, independiente, transparente, responsable y objetivo, que trabajará en pro de la generación de acuerdos con las autoridades de los tres órdenes de gobierno para el establecimiento de políticas públicas en torno al agua y medio ambiente que tengan como eje la sustentabilidad. Su funcionamiento será incluyente, participativo, democrático y con perspectiva de género, y la información que produzca será de carácter público y libre. Aunque el interés es tener un alcance estatal, la primera meta era comenzar con una influencia a nivel de la zona metropolitana de los Valles Centrales.

Rumbo a la conformación del mismo se realizaron dos reuniones informativas, la primera el 30 de enero y la segunda el 15 de abril del 2024, ambas se llevaron a cabo en el Instituto de Artes Gráficas de Oaxaca. Se convocó a diversas organizaciones de la sociedad civil e instituciones de investigación quienes aportaron con ideas y propuestas de cómo se podría conformar dicho Observatorio. Con estos insumos se construyó la propuesta colectiva de Acta Constitutiva, la cual se firmó el 9 de mayo del 2024 con la representación de 28 organizaciones.